基于医学科研与临床应用的药物知识库研究进展

doi:10.3877/cma.j.issn.1674-0785.2021.01.014

中华临床医师杂志(电子版) ›› 2021, Vol. 15 ›› Issue (01) : 72 -78. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-0785.2021.01.014

所属专题：文献；

综述

基于医学科研与临床应用的药物知识库研究进展

潘文洁¹, 尹泽宇², 侯婉馨³, Jawad Hussain³, 张远鹏¹, 姚敏⁴, 王理³^,^†(

)

^1. 226001　江苏南通，南通大学医学院医学信息学系1
^2. 226001　江苏南通，南通大学信息科学技术学院2；226001　江苏南通，南通大学智能信息技术研究中心3
^3. 226001　江苏南通，南通大学信息科学技术学院2；226001　江苏南通，南通大学智能信息技术研究中心3；226001　江苏南通，南通先进通信技术研究院有限公司4
^4. 226001　江苏南通，南通大学医学院免疫教研室5

收稿日期:2020-07-20 出版日期:2021-01-15
通信作者: 王理
基金资助:
国家自然科学基金(81873915); 科技部国家重点研发计划(2018YFC0116902); 南通市科技项目(MS12020021)

Research progress of drug knowledge bases based on medical research and clinical application

Wenjie Pan¹, Zeyu Yin², Wanxin Hou³, Jawad Hussain³, Yuanpeng Zhang¹, Min Yao⁴, Li Wang³^,^†()

^1. Department of Medical Informatics, Medical School of Nantong University, Nantong 226001, China
^2. School of Information Science and Technology, Nantong University, Nantong 226001, China; Research Center for Intelligence Information Technology, Nantong University, Nantong 226001, China
^3. School of Information Science and Technology, Nantong University, Nantong 226001, China; Research Center for Intelligence Information Technology, Nantong University, Nantong 226001, China; Nantong Research Institute for Advanced Communication Technologies, Nantong 226001, China
^4. Department of Immunology, Medical School of Nantong University, Nantong 226001, China

Received:2020-07-20 Published:2021-01-15
Corresponding author: Li Wang

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引用本文：

潘文洁, 尹泽宇, 侯婉馨, Jawad Hussain, 张远鹏, 姚敏, 王理. 基于医学科研与临床应用的药物知识库研究进展[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2021, 15(01): 72-78.

Wenjie Pan, Zeyu Yin, Wanxin Hou, Jawad Hussain, Yuanpeng Zhang, Min Yao, Li Wang. Research progress of drug knowledge bases based on medical research and clinical application[J]. Chinese Journal of Clinicians(Electronic Edition), 2021, 15(01): 72-78.

药物知识库是基于人工智能算法构建，用于整合现有药物知识和挖掘有效知识的知识库。目前，药物知识库已应用于抗菌药物监管、合理药物指导、健康管理干预和临床决策等临床活动中。同时，科研人员基于药物知识库进行如不良反应分析、药物重利用、耐药性研究和药物基因组研究等研究。本文就近年来有关药物知识库在科研和临床中的研究进展进行综述，希望为进一步探讨药物知识库的开发与利用带来新思路。

关键词: 药物知识库, 人工智能, 医学应用

The drug knowledge base is constructed based on artificial intelligence algorithms, which is used to integrate existing drug knowledge and tap effective knowledge. Currently, drug knowledge bases have been used in clinical research such as antimicrobial drug supervision, rational drug guidance, health management intervention, and clinical decision support. Based on the drug knowledge bases, researchers perform scientific research such as adverse drug reaction analysis, drug repurposing, drug resistance analysis, system pharmacogenomics analysis, and so on. In this paper, we review the progress of the drug knowledge bases in scientific and clinical research, in order to shed some light on the further application and development of the drug knowledge bases.

Key words: Drug knowledge bases, Artificial intelligence, Medical applications

表1 药物知识库的应用举例

应用类别	应用领域	药物知识库
医学科研	不良反应分析	Anatomical therapeutic chemical classification（ATC）^[11]
		drug target ontology（DTO）^[11]
	潜在的药物相互作用分析	First DataBank（FDB）^[12]
		Micromedex^[12]
		Multum^[12]
	药物重利用	GNBR^[7]
		Wikidata^[13]
	药物基因组研究	全基因组转录表达数据库^[14]
		PharmGED数据库^[15]
		ChemProt数据库^[16]
		GPCR本体数据库^[17]
	科研管理	中医药机构知识库^[18]
	耐药性研究	CancerDR^[19]
		DbMDR^[20]
	药物发现	ADMETNet^[21]
		canSAR^[22]
医学临床	合理用药指导	儿童用药指导知识库^[23]
	健康管理干预	中医健康状况干预知识库^[24]
	临床决策	川崎病知识图谱^[25]
	抗菌药物监管	抗菌药物知识库^[26]

表1 药物知识库的应用举例

应用类别	应用领域	药物知识库
医学科研	不良反应分析	Anatomical therapeutic chemical classification（ATC）^[11]
		drug target ontology（DTO）^[11]
	潜在的药物相互作用分析	First DataBank（FDB）^[12]
		Micromedex^[12]
		Multum^[12]
	药物重利用	GNBR^[7]
		Wikidata^[13]
	药物基因组研究	全基因组转录表达数据库^[14]
		PharmGED数据库^[15]
		ChemProt数据库^[16]
		GPCR本体数据库^[17]
	科研管理	中医药机构知识库^[18]
	耐药性研究	CancerDR^[19]
		DbMDR^[20]
	药物发现	ADMETNet^[21]
		canSAR^[22]
医学临床	合理用药指导	儿童用药指导知识库^[23]
	健康管理干预	中医健康状况干预知识库^[24]
	临床决策	川崎病知识图谱^[25]
	抗菌药物监管	抗菌药物知识库^[26]

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