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中华临床医师杂志(电子版) ›› 2023, Vol. 17 ›› Issue (12) : 1219 -1222. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-0785.2023.12.003

专题笔谈

雷公藤属数据库的开发与应用
王江瑞, 蔡蓓蕾, 王学政, 王磊, 陈同, 张彦琼, 王亚丹()   
  1. 400800 重庆,重庆市药研院制药有限公司;214194 无锡,江苏知原药业股份有限公司
    214194 无锡,江苏知原药业股份有限公司
    400800 重庆,重庆市药研院制药有限公司
    100700 北京,中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地
    100700 北京,中国中医科学院 中药研究所
    100050 北京,中国食品药品检定研究院
  • 收稿日期:2023-08-13 出版日期:2023-12-15
  • 通信作者: 王亚丹
  • 基金资助:
    重庆市科技部“科技助力经济2020”重点专项(SQ2020YFF0417688)

Development and application of a Tripterygium wilfordii database

Jiangrui Wang, Beilei Cai, Xuezheng Wang, Lei Wang, Tong Chen, Yanqiong Zhang, Yadan Wang()   

  1. Pharmceutical Factory of the Chongqing Academy of Chinese Materia Medica, Chongqing 400800, China;Sinomune Pharmaceutical Co., Ltd, Wuxi 214194, China
    Sinomune Pharmaceutical Co., Ltd, Wuxi 214194, China
    Pharmceutical Factory of the Chongqing Academy of Chinese Materia Medica, Chongqing 400800, China
    State Key Laboratory Breeding Base of Daodi Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China
    Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China
    National Institutes for Food and Drug Control, Beijing 100050, China
  • Received:2023-08-13 Published:2023-12-15
  • Corresponding author: Yadan Wang
引用本文:

王江瑞, 蔡蓓蕾, 王学政, 王磊, 陈同, 张彦琼, 王亚丹. 雷公藤属数据库的开发与应用[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(12): 1219-1222.

Jiangrui Wang, Beilei Cai, Xuezheng Wang, Lei Wang, Tong Chen, Yanqiong Zhang, Yadan Wang. Development and application of a Tripterygium wilfordii database[J]. Chinese Journal of Clinicians(Electronic Edition), 2023, 17(12): 1219-1222.

以雷公藤属雷公藤、昆明山海棠、东北雷公藤三味中药为基础,整合其中药及复方知识,以现有文献型数据库、药代动力学和毒性在线预测平台(ADMETlab 2.0数据库)、中药系统药理数据库(TCMSP数据库)、中医药百科全书(ETCM数据库)以及2020版《中国药典》为数据整理制作基础数据库,并对数据库内容进行重新关联及建设。雷公藤属数据库(TWD)共收集相关中成药方剂14首,方剂相关药材53味,相关化学成分4 000余个,相关疾病靶标2 000余个,相关疾病20种,内容涵盖药材产地、性味归经、指标成分、配伍禁忌、现代应用等多个维度。包括药材、方剂、成分、靶标、疾病5个子数据库及1个分析系统,通过主数据库与二级表建立超链接,实现各个数据库表数据的交互检索。通过整理、融合专业知识,结合数据库的专业前沿技术,使用中英文对照形式建立的TWD,将雷公藤属的中药信息系统、准确、全面、综合、可视化地呈现,为雷公藤属植物药的开发与临床应用奠定基础,推动雷公藤属领域研究国际化。

Being based on the three traditional Chinese medicines Tripterygium wilfordii Hook. f., Tripterygium hypoglaucum (Levl.) Hutch, and Tripterygium regelii Spragus et Takeda, integrating the knowledge of Chinese medicines and compound prescriptions, and combining the data from the existing literature database, ADMETlab 2.0 database, Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform database (TCMSP), The Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine database (ETCM), and the 2020 edition of Chinese Pharmacopoeia, a basic database was generated. Then, the database content was re-associated and constructed. The Tripterygium wilfordii database (TWD) collects a total of 14 related Chinese patent medicine prescriptions, 33 related medicinal materials, more than 4000 related chemical components, more than 2000 related disease targets, and 20 related diseases, covering the origin of medicinal materials, flavor and meridian tropism, index components, incompatibility, modern application, and other dimensions. It includes five sub-databases of medicinal materials, prescriptions, ingredients, targets, and diseases and one analysis system. Hyperlinks are established between the primary database and the secondary table to realize the interactive retrieval of data from each database table. By collation and integration of professional knowledge, combined with the professional frontier technology of the database, the TWD was established in a bilingual (Chinese-English) form, presenting the traditional Chinese medicine information of Tripterygium wilfordii systematically, accurately, comprehensively, synthetically, and visually, laying the foundation for the development and clinical application of Tripterygium wilfordii botanical drugs and promoting the internationalization of Tripterygium wilfordii research.

1
中国科学院中国植物志编辑委员会.中国植物志.第45卷3分册[M].北京:科学出版社, 1999:178.
2
Li T, Xie J, Li Y, et al. Tripterygium wilfordii Hook F extract in cART-treated HIV patients with poor immune response: a pilot study to assess its immunomodulatory effects and safety [J]. HIV Clin Trials, 2015,16(2):49-56.
3
Abdin AA, Hasby EA. Modulatory effect of celastrol on Th1/Th2 cytokines profile, TLR2 and CD3+ T-lymphocyte expression in a relapsing-remitting model of multiple sclerosis in rats [J]. Eur J Pharmacol, 2014,742:102-112.
4
Li H, Pan GF, Jiang ZZ, et al. Triptolide inhibits human breast cancer MCF-7 cell growth via downregulation of the ERα-mediated signaling pathway [J]. Acta Pharmacol Sin, 2015,36(5):606-613.
5
Jiang X, Huang XC, Ao L, et al. Total alkaloids of Tripterygium hypoglaucum (levl.) Hutch inhibits tumor growth both in vitro and in vivo [J]. J Ethnopharmacol, 2014,151(1):292-298.
6
Hong Z, Wang G, Gu J, et al. Tripchlorolide protects against MPTP-induced neurotoxicity in C57BL/6 mice [J]. Eur J Neurosci, 2007,26(6):1500-1508.
7
Mao X, Wang K, Liu Y, et al. Computational repurposing and preclinical validation of colquhounia root tablets for membranous nephropathy [J]. Clin Transl Med, 2023,13(3):e1143.
8
Ma Z, Liu Y, Li C, et al. Repurposing a clinically approved prescription Colquhounia root tablet to treat diabetic kidney disease via suppressing PI3K/AKT/NF-kB activation [J]. Chin Med, 2022,17(1):2.
9
许海玉, 刘振明, 付岩,等. 中药整合药理学计算平台的开发与应用 [J]. 中国中药杂志,2017,42(18):3633-3638.
10
马璐, 田国祥, 耿辉,等. 中药系统药理数据库TCMSP及其分析应用简介 [J]. 中国循证心血管医学杂志,2020(12): 1413-1416.
11
何英蒙, 姚媛媛, 陈一龙,等. 雷公藤类制剂的研究进展 [J]. 中国药房,2017,28(4):551-553,554.
12
杨小红, 张伟程. 雷公藤制剂的应用及其副作用 [J]. 中医药临床杂志,2004,16(5):511-512.
13
钟颖, 赵潇, 赵建权,等. 火把花根片药理作用及临床应用研究进展 [J]. 药物评价研究,2021,44(9):2020-2027.
14
李金花, 李军, 王君明,等. 雷公藤联合用药的研究进展 [J]. 中国老年学杂志,2016,36(24):6280-6282.
15
朱胜楠, 张靖, 贾路路,等. 雷公藤药理作用及临床应用研究进展 [J]. 世界最新医学信息文摘,2019,19(18):15-16.
16
胡德俊, 彭泽燕, 何东初. 雷公藤的药理作用研究进展 [J]. 医药导报,2018,37(5):586-592.
17
汝锦龙.中药系统药理学数据库和分析平台的构建和应用[D].西安: 西北农林科技大学,2015.
[1] 林桦, 秦超, 骆宁, 刘宏伟, 于泳浩. 烧伤大鼠肝组织关键基因的筛选[J]. 中华危重症医学杂志(电子版), 2023, 16(06): 448-452.
[2] 田发兰, 陈见中, 扎西卓玛, 喻定刚. 三维可视化技术在复杂泡型肝包虫病治疗中的临床应用[J]. 中华普通外科学文献(电子版), 2023, 17(04): 257-261.
[3] 王斌, 王静, 黄赞胜, 王苹, 王创业, 张硕辛, 秦蘅, 孙晓容, 吴红梅, 胡晋, 杨昱, 张明周, 李力, 徐智. 肺超声可视化支气管肺泡灌洗在肺外周病灶诊断中的应用[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2023, 16(04): 466-470.
[4] 谭玲芳, 周克兵. 基于生物信息学整合鉴定与支气管哮喘相关的潜在诊断生物标志物[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2023, 16(03): 329-334.
[5] 孟令展, 李虎, 俞鹏, 于燕宾, 曹李, 翟伟, 高远, 邵艳玲, 严锦, 朱震宇. ICG荧光染色在肝癌腹腔镜解剖性肝切除术中的应用[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2023, 12(05): 557-561.
[6] 高旭东, 王小明, 陈江明, 奚士航, 潘璇. 基于三维可视化技术的脾门区脾动脉三维分型[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2023, 12(04): 434-439.
[7] 王立涛, 刘恩瑞, 李振鲁, 吴昌亮, 高鹏. 基于SEER数据库手术后原发性阑尾肿瘤患者预后列线图构建与验证[J]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2023, 12(05): 404-414.
[8] 崔梦凡, 贺瑞, 李晓娜, 陈维毅, 宋耀文. 角膜生物力学评估参数的应用进展[J]. 中华眼科医学杂志(电子版), 2023, 13(04): 236-240.
[9] 马木提江·木尔提扎, 汪永新, 阿西木江·阿西尔, 姜彦文, 秦虎. 多模态三维影像融合技术在颅内功能区病变手术中的应用[J]. 中华神经创伤外科电子杂志, 2023, 09(05): 302-307.
[10] 李海马, 孙恺, 刘如恩. 颅内单纯生殖细胞瘤患者的生存预测:基于SEER数据库的临床研究[J]. 中华神经创伤外科电子杂志, 2023, 09(05): 283-288.
[11] 张敏洁, 王雅晳, 段莎莎, 施依璐, 付文艳, 赵海玥, 张小杉. 基于GEO数据库和生物信息学分析筛选大鼠心肌缺血再灌注损伤相关潜在通路和靶点[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(04): 438-445.
[12] 古士锋, 张丽姿, 梁景英, 杜丽丽, 孙雯, 陈敦金. 2011-2021年我国胎盘植入性疾病研究热点:基于CiteSpace可视化分析[J]. 中华产科急救电子杂志, 2023, 12(03): 159-166.
[13] 姜巧, 张溱乐, 张艳玲, 余展鹏. 基于MIMIC-Ⅲ数据库的急性胰腺炎并发脓毒症风险预测模型构建与评价[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2023, 11(03): 151-157.
[14] 高子昂, 段天骄, 谭玉勇, 刘德良, 段天英. 消化内镜隧道技术国内外研究现状及发展趋势的可视化分析[J]. 中华胃肠内镜电子杂志, 2023, 10(03): 159-166.
[15] 林淼, 张绍元, 冯明祥, 谭黎杰, 丁建勇. 国内外胸腺瘤研究现状与趋势的文献可视化分析[J]. 中华胸部外科电子杂志, 2023, 10(04): 213-223.
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